Checklist 12 bước kiểm tra tờ khai thuế GTGT trước khi nộp (kế toán cần biết)

Hướng dẫn checklist 12 bước kiểm tra tờ khai thuế GTGT trước khi nộp cho cơ quan thuế. Giúp kế toán phát hiện sai sót hóa đơn, thuế đầu vào, đầu ra và hạn chế rủi ro bị truy thu thuế. Tham khảo thêm Quy định mới về thuế GTGT theo Thông tư 18/2026/TT-BTC

1. Kiểm tra đầy đủ hóa đơn đầu ra

Trước tiên cần đảm bảo:

  • Tất cả hóa đơn bán hàng trong kỳ đã được ghi nhận

  • Không thiếu hóa đơn doanh thu

Một sai sót nhỏ ở bước này có thể dẫn đến kê khai thiếu doanh thu chịu thuế.

Ví dụ:  Doanh nghiệp bán hàng ngày 30/04 nhưng kế toán quên nhập hóa đơn vào phần mềm → tờ khai thiếu doanh thu.

2. Đối chiếu doanh thu với hệ thống hóa đơn điện tử

Cần đối chiếu:

  • Doanh thu trên phần mềm kế toán

  • Doanh thu trên hệ thống hóa đơn điện tử

Hai số liệu này phải khớp nhau.

Nếu lệch, cần tìm nguyên nhân:

  • Hóa đơn hủy (Đối với hóa đơn trước thời điểm 1/7/2025)

  • Hóa đơn điều chỉnh, Thay thế

  • Nhập sai dữ liệu.

3. Kiểm tra thuế suất GTGT của từng hóa đơn

Các mức thuế suất phổ biến:

  • 0%

  • 5%

  • 10%

Cần rà soát xem hóa đơn có áp dụng đúng thuế suất hay không.

Ví dụ 

Thiết bị y tế → 5%
Nhưng kế toán xuất hóa đơn → 10%

Sai sót này phải điều chỉnh hóa đơn.

4. Kiểm tra tính hợp lệ của hóa đơn đầu vào

Hóa đơn đầu vào phải đảm bảo:

  • Đúng tên doanh nghiệp

  • Đúng mã số thuế

  • Đúng thời điểm lập hóa đơn

Ngoài ra nên kiểm tra trên hệ thống tra cứu hóa đơn của cơ quan thuế. Hoặc sử dụng Giải pháp Quản lý Rủi ro hóa đơn của M-invoice


5. Kiểm tra điều kiện khấu trừ VAT đầu vào

Thuế GTGT đầu vào chỉ được khấu trừ khi:

  • Hóa đơn hợp pháp

  • Phục vụ hoạt động kinh doanh chịu thuế

  • Thanh toán không dùng tiền mặt đối với hóa đơn giá trị lớn hơn 5 triệu

Ví dụ

Hóa đơn mua máy tính:

  • Giá trị: 50 triệu

  • Thanh toán tiền mặt

→ VAT đầu vào không được khấu trừ.

6. Kiểm tra các hóa đơn bị hủy hoặc điều chỉnh

Nếu trong kỳ có:

  • Hóa đơn thay thế (hủy đối với hóa đơn Theo quy định cũ)

  • hóa đơn điều chỉnh

Cần đảm bảo đã kê khai điều chỉnh đúng kỳ.

7. Kiểm tra hàng trả lại hoặc giảm giá

Các trường hợp:

  • Trả hàng

  • Chiết khấu

  • Giảm giá sau bán

Cần xuất hóa đơn điều chỉnh và cập nhật lại thuế GTGT đầu ra.

8. Đối chiếu VAT đầu vào với sổ kế toán

Cần kiểm tra:

  • VAT đầu vào trên tờ khai

  • VAT đầu vào trên sổ kế toán

Hai số liệu phải khớp nhau.

Nếu không khớp, có thể do:

  • Bỏ sót hóa đơn

  • Nhập sai dữ liệu.

9. Kiểm tra VAT đầu vào không được khấu trừ

Một số chi phí có VAT nhưng không được khấu trừ, ví dụ:

  • Chi phí không phục vụ kinh doanh

  • Hóa đơn không hợp lệ

Những khoản này cần loại khỏi tờ khai.

10. Kiểm tra số thuế GTGT còn được khấu trừ

Cần đối chiếu:

  • Số thuế còn được khấu trừ kỳ trước

  • Số chuyển sang kỳ này

Nếu nhập sai sẽ làm sai toàn bộ tờ khai.

11. Kiểm tra số liệu trước khi kết xuất tờ khai

Trước khi nộp cần rà soát:

  • Tổng doanh thu chịu thuế

  • Tổng VAT đầu ra

  • Tổng VAT đầu vào

  • Số thuế phải nộp

Nếu số thuế biến động lớn so với tháng trước cần kiểm tra lại.

12. Kiểm tra file tờ khai trước khi nộp

Trước khi gửi tờ khai lên cổng thuế điện tử cần kiểm tra:

  • Đúng kỳ kê khai

  • Đúng mã số thuế

  • Đúng loại tờ khai (tháng hoặc quý)

Một lỗi nhỏ ở bước này có thể khiến tờ khai bị từ chối.

Kết luận

Một checklist đơn giản có thể giúp doanh nghiệp:

  • Giảm sai sót thuế

  • Tránh bị truy thu

  • Hạn chế rủi ro thanh tra thuế

Thực tế cho thấy, những doanh nghiệp có quy trình kiểm tra tờ khai thuế trước khi nộp thường giảm tới 80–90% sai sót về thuế. Loại bỏ đến 98% những rủi ro thuế về hóa đơn với Giải pháp Quản lý rủi ro hóa đơn mSMI của M-invoice