Cơ quan Thuế vừa ban hành hướng dẫn triển khai xử lý các trường hợp hóa đơn giá trị gia tăng (GTGT) kiêm tờ khai hoàn thuế lập sai trên Hệ thống hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài thuộc Hệ thống miễn, giảm, hoàn, không thu thuế điện tử. Nội dung này đang được nhiều doanh nghiệp bán hàng hoàn thuế đặc biệt quan tâm nhằm đảm bảo hồ sơ hoàn thuế cho khách nước ngoài được xử lý đúng quy định.
Dưới đây là toàn bộ nội dung doanh nghiệp cần lưu ý về việc xử lý hóa đơn GTGT kiêm tờ khai hoàn thuế điện tử lập sai theo hướng dẫn mới nhất từ cơ quan Hải quan và cơ quan Thuế.
Cơ quan Thuế triển khai hướng dẫn xử lý hóa đơn GTGT kiêm tờ khai hoàn thuế lập sai
Theo nội dung công văn, Cục Thuế nhận được Công văn số 41186/CHQ-NVTHQ ngày 08/12/2025 của Cục Hải quan liên quan đến việc xử lý các trường hợp lập sai hóa đơn GTGT kiêm tờ khai hoàn thuế trên Phân hệ hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài.
Tải ngay Công-văn-2584-CT-QLTT
Nhằm tạo thuận lợi cho doanh nghiệp bán hàng hoàn thuế GTGT và người nước ngoài thực hiện hoàn thuế khi xuất cảnh, cơ quan Thuế đề nghị các Chi cục Thuế địa phương thông báo đến doanh nghiệp để kịp thời thực hiện điều chỉnh, thay thế hóa đơn theo đúng quy định.
Căn cứ pháp lý xử lý hóa đơn GTGT lập sai
Việc xử lý hóa đơn điện tử lập sai được thực hiện căn cứ theo các văn bản:
- Nghị định 70/2025/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung quy định về hóa đơn, chứng từ;
- Nghị định 123/2020/NĐ-CP;
- Nghị định 181/2025/NĐ-CP;
- Thông tư 92/2019/TT-BTC;
- Thông tư 72/2014/TT-BTC của Bộ Tài chính.
Các quy định này là cơ sở để cơ quan Hải quan và cơ quan Thuế đối chiếu dữ liệu khi giải quyết hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài.
Doanh nghiệp xử lý hóa đơn GTGT kiêm tờ khai hoàn thuế lập sai như thế nào?
Theo hướng dẫn mới, trường hợp doanh nghiệp bán hàng thực hiện thay thế hoặc điều chỉnh hóa đơn GTGT kiêm tờ khai hoàn thuế điện tử đã lập sai thì cơ quan Hải quan sẽ thực hiện kiểm tra, đối chiếu dữ liệu giữa:
- Thông tin trên hộ chiếu hoặc giấy tờ xuất nhập cảnh;
- Thông tin trên hóa đơn GTGT kiêm tờ khai hoàn thuế;
- Dữ liệu trên Hệ thống quản lý hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài;
- Dữ liệu hóa đơn điện tử của cơ quan Thuế.
Việc đối chiếu nhằm đảm bảo thông tin hoàn thuế chính xác, hạn chế rủi ro sai lệch dữ liệu trong quá trình xử lý hoàn thuế cho người nước ngoài khi xuất cảnh.
Các trường hợp xử lý hóa đơn GTGT điện tử lập sai
Trường hợp sai tên, địa chỉ người mua nhưng không sai mã số thuế
Nếu người bán phát hiện hóa đơn điện tử lập sai:
- Tên người mua;
- Địa chỉ người mua;
nhưng không sai mã số thuế và các nội dung khác thì doanh nghiệp thực hiện:
- Thông báo hóa đơn điện tử có sai sót theo Mẫu số 04/SS-HĐĐT;
- Cơ quan Thuế tiếp nhận theo Mẫu số 01/TB-SSĐT.
Đây là trường hợp không bắt buộc lập hóa đơn thay thế nếu các thông tin còn lại vẫn chính xác.
Trường hợp sai mã số thuế, tiền thuế hoặc nội dung hàng hóa
Doanh nghiệp phải lập hóa đơn mới thay thế hoặc điều chỉnh nếu hóa đơn điện tử có sai sót về:
- Mã số thuế;
- Số tiền ghi trên hóa đơn;
- Thuế suất, tiền thuế;
- Quy cách, chất lượng hàng hóa.
Thông tin trên hóa đơn mới sẽ được cơ quan Hải quan đối chiếu với dữ liệu hoàn thuế và hệ thống hóa đơn điện tử của cơ quan Thuế trước khi xử lý hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài.
Trường hợp cơ quan Thuế phát hiện hóa đơn lập sai
Nếu cơ quan Thuế phát hiện hóa đơn điện tử đã lập sai, doanh nghiệp sẽ nhận thông báo theo:
- Mẫu số 01/TB-RSĐT ban hành kèm Nghị định 70/2025/NĐ-CP.
Khi đó, doanh nghiệp phải thực hiện điều chỉnh hoặc thay thế hóa đơn theo đúng hướng dẫn của cơ quan Thuế.
Cơ quan Thuế yêu cầu các địa phương triển khai đồng bộ
Theo chỉ đạo của Cục Thuế:
- Các Chi cục Thuế tỉnh, thành phố phải thông báo đến doanh nghiệp bán hàng hoàn thuế GTGT trên địa bàn;
- Kịp thời tổng hợp các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện;
- Báo cáo về Cục Thuế để được hướng dẫn xử lý.
Việc triển khai đồng bộ nhằm đảm bảo hệ thống hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài vận hành thống nhất, hạn chế phát sinh sai sót trong quá trình xuất cảnh và hoàn thuế.
Doanh nghiệp cần lưu ý gì?
Doanh nghiệp bán hàng hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài cần lưu ý:
- Rà soát kỹ thông tin trên hóa đơn trước khi phát hành;
- Kiểm tra chính xác thông tin hộ chiếu, giấy tờ xuất nhập cảnh;
- Thực hiện điều chỉnh/thay thế hóa đơn đúng quy định khi phát hiện sai sót;
- Lưu trữ đầy đủ hồ sơ liên quan để phục vụ đối chiếu khi cơ quan Hải quan kiểm tra hoàn thuế.
Đặc biệt, việc đồng bộ dữ liệu giữa hệ thống hóa đơn điện tử và hệ thống hoàn thuế GTGT đang được cơ quan quản lý siết chặt nhằm hạn chế rủi ro gian lận và sai lệch thông tin.
Kết luận
Hướng dẫn mới của cơ quan Thuế và Hải quan về xử lý hóa đơn GTGT kiêm tờ khai hoàn thuế lập sai giúp doanh nghiệp có cơ sở rõ ràng để thực hiện điều chỉnh hóa đơn đúng quy định, đồng thời tạo thuận lợi cho quá trình hoàn thuế GTGT cho người nước ngoài khi xuất cảnh.
Doanh nghiệp cần chủ động cập nhật quy định mới, rà soát dữ liệu hóa đơn và phối hợp chặt chẽ với cơ quan Thuế, cơ quan Hải quan để đảm bảo việc hoàn thuế được xử lý nhanh chóng, chính xác và đúng quy định pháp luật.


